Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G9

DYNC1LI1, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DYNC1LI1Q9Y6G9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DYNC1LI1Q9Y6G9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms