Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F8

CDY1, Testis-specific chromodomain protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDY1Q9Y6F8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDY1Q9Y6F8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDY1Q9Y6F8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDY1Q9Y6F8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDY1Q9Y6F8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDY1Q9Y6F8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDY1Q9Y6F8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDY1Q9Y6F8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDY1Q9Y6F8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDY1Q9Y6F8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDY1Q9Y6F8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDY1Q9Y6F8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDY1Q9Y6F8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDY1Q9Y6F8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDY1Q9Y6F8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDY1Q9Y6F8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDY1Q9Y6F8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDY1Q9Y6F8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CDY1Q9Y6F8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDY1Q9Y6F8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDY1Q9Y6F8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDY1Q9Y6F8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDY1Q9Y6F8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDY1Q9Y6F8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDY1Q9Y6F8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDY1Q9Y6F8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDY1Q9Y6F8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDY1Q9Y6F8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CDY1Q9Y6F8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDY1Q9Y6F8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDY1Q9Y6F8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CDY1Q9Y6F8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDY1Q9Y6F8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDY1Q9Y6F8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDY1Q9Y6F8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDY1Q9Y6F8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDY1Q9Y6F8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDY1Q9Y6F8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDY1Q9Y6F8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDY1Q9Y6F8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDY1Q9Y6F8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDY1Q9Y6F8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDY1Q9Y6F8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDY1Q9Y6F8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDY1Q9Y6F8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDY1Q9Y6F8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDY1Q9Y6F8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDY1Q9Y6F8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CDY1Q9Y6F8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDY1Q9Y6F8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDY1Q9Y6F8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDY1Q9Y6F8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms