Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC1Q9Y5R8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms