Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCDHB2Q9Y5E7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB2Q9Y5E7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.7 ms