Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X8

UBE2D4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D4, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D4Q9Y2X8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2D4Q9Y2X8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms