Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2H6

FNDC3A, Fibronectin type-III domain-containing protein 3A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC3AQ9Y2H6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FNDC3AQ9Y2H6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms