Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQR0

SCML2, Sex comb on midleg-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML2Q9UQR0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCML2Q9UQR0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCML2Q9UQR0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms