Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TNNQ9UQP3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNNQ9UQP3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms