Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHOC2Q9UQ13 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHOC2Q9UQ13 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
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