Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMG5Q9UPR3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMG5Q9UPR3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms