Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX7Q9UNH6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX7Q9UNH6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms