Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
L1RE1Q9UN81 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms