Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DENND2AQ9ULE3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DENND2AQ9ULE3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms