Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRPF3Q9ULD4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRPF3Q9ULD4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRPF3Q9ULD4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRPF3Q9ULD4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRPF3Q9ULD4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRPF3Q9ULD4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRPF3Q9ULD4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRPF3Q9ULD4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRPF3Q9ULD4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
BRPF3Q9ULD4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRPF3Q9ULD4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRPF3Q9ULD4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRPF3Q9ULD4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRPF3Q9ULD4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
BRPF3Q9ULD4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRPF3Q9ULD4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRPF3Q9ULD4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRPF3Q9ULD4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRPF3Q9ULD4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRPF3Q9ULD4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRPF3Q9ULD4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRPF3Q9ULD4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRPF3Q9ULD4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRPF3Q9ULD4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRPF3Q9ULD4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRPF3Q9ULD4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRPF3Q9ULD4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRPF3Q9ULD4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRPF3Q9ULD4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRPF3Q9ULD4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
BRPF3Q9ULD4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BRPF3Q9ULD4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BRPF3Q9ULD4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BRPF3Q9ULD4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRPF3Q9ULD4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms