Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PNMA3Q9UL41 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms