Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC2LQ9UL33 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC2LQ9UL33 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms