Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA11Q9UKX5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA11Q9UKX5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA11Q9UKX5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms