Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GJD2Q9UKL4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJD2Q9UKL4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJD2Q9UKL4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJD2Q9UKL4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GJD2Q9UKL4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJD2Q9UKL4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GJD2Q9UKL4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJD2Q9UKL4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJD2Q9UKL4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJD2Q9UKL4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJD2Q9UKL4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJD2Q9UKL4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJD2Q9UKL4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJD2Q9UKL4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJD2Q9UKL4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GJD2Q9UKL4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJD2Q9UKL4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJD2Q9UKL4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJD2Q9UKL4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJD2Q9UKL4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJD2Q9UKL4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJD2Q9UKL4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJD2Q9UKL4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJD2Q9UKL4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJD2Q9UKL4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJD2Q9UKL4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJD2Q9UKL4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJD2Q9UKL4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJD2Q9UKL4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJD2Q9UKL4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GJD2Q9UKL4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJD2Q9UKL4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJD2Q9UKL4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJD2Q9UKL4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJD2Q9UKL4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJD2Q9UKL4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJD2Q9UKL4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJD2Q9UKL4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJD2Q9UKL4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJD2Q9UKL4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GJD2Q9UKL4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GJD2Q9UKL4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJD2Q9UKL4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms