Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PARP4Q9UKK3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PARP4Q9UKK3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PARP4Q9UKK3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PARP4Q9UKK3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PARP4Q9UKK3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PARP4Q9UKK3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PARP4Q9UKK3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PARP4Q9UKK3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PARP4Q9UKK3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PARP4Q9UKK3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PARP4Q9UKK3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PARP4Q9UKK3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PARP4Q9UKK3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PARP4Q9UKK3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PARP4Q9UKK3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PARP4Q9UKK3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PARP4Q9UKK3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PARP4Q9UKK3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PARP4Q9UKK3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PARP4Q9UKK3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PARP4Q9UKK3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PARP4Q9UKK3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PARP4Q9UKK3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PARP4Q9UKK3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PARP4Q9UKK3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PARP4Q9UKK3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PARP4Q9UKK3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PARP4Q9UKK3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PARP4Q9UKK3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PARP4Q9UKK3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PARP4Q9UKK3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PARP4Q9UKK3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PARP4Q9UKK3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PARP4Q9UKK3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PARP4Q9UKK3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PARP4Q9UKK3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PARP4Q9UKK3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PARP4Q9UKK3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PARP4Q9UKK3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PARP4Q9UKK3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PARP4Q9UKK3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PARP4Q9UKK3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PARP4Q9UKK3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PARP4Q9UKK3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms