Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SALL4Q9UJQ4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SALL4Q9UJQ4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SALL4Q9UJQ4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 390.3 ms