Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAX2Q9UIW0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAX2Q9UIW0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms