Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP25Q9UHP3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP25Q9UHP3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP25Q9UHP3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP25Q9UHP3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
USP25Q9UHP3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP25Q9UHP3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
USP25Q9UHP3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP25Q9UHP3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP25Q9UHP3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP25Q9UHP3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP25Q9UHP3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP25Q9UHP3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP25Q9UHP3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP25Q9UHP3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP25Q9UHP3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP25Q9UHP3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP25Q9UHP3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP25Q9UHP3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP25Q9UHP3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP25Q9UHP3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP25Q9UHP3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP25Q9UHP3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP25Q9UHP3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP25Q9UHP3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP25Q9UHP3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP25Q9UHP3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP25Q9UHP3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP25Q9UHP3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP25Q9UHP3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP25Q9UHP3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP25Q9UHP3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP25Q9UHP3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP25Q9UHP3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP25Q9UHP3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP25Q9UHP3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP25Q9UHP3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
USP25Q9UHP3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP25Q9UHP3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP25Q9UHP3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP25Q9UHP3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP25Q9UHP3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP25Q9UHP3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP25Q9UHP3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP25Q9UHP3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP25Q9UHP3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP25Q9UHP3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
USP25Q9UHP3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP25Q9UHP3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP25Q9UHP3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP25Q9UHP3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP25Q9UHP3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms