Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHORDC1Q9UHD1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHORDC1Q9UHD1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms