Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC3BQ9UH17 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC3BQ9UH17 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms