Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA9Q9UGM1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms