Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAJB4Q9UDY4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms