Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPS7AQ9UBW8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COPS7AQ9UBW8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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