Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS5

GABBR1, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABBR1Q9UBS5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABBR1Q9UBS5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABBR1Q9UBS5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABBR1Q9UBS5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABBR1Q9UBS5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABBR1Q9UBS5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABBR1Q9UBS5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABBR1Q9UBS5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABBR1Q9UBS5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABBR1Q9UBS5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABBR1Q9UBS5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABBR1Q9UBS5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABBR1Q9UBS5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABBR1Q9UBS5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABBR1Q9UBS5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABBR1Q9UBS5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABBR1Q9UBS5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABBR1Q9UBS5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABBR1Q9UBS5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABBR1Q9UBS5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABBR1Q9UBS5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABBR1Q9UBS5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABBR1Q9UBS5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABBR1Q9UBS5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABBR1Q9UBS5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABBR1Q9UBS5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABBR1Q9UBS5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABBR1Q9UBS5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABBR1Q9UBS5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABBR1Q9UBS5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABBR1Q9UBS5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABBR1Q9UBS5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GABBR1Q9UBS5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABBR1Q9UBS5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABBR1Q9UBS5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABBR1Q9UBS5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABBR1Q9UBS5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABBR1Q9UBS5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABBR1Q9UBS5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABBR1Q9UBS5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABBR1Q9UBS5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABBR1Q9UBS5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GABBR1Q9UBS5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABBR1Q9UBS5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABBR1Q9UBS5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABBR1Q9UBS5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABBR1Q9UBS5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABBR1Q9UBS5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABBR1Q9UBS5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GABBR1Q9UBS5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GABBR1Q9UBS5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GABBR1Q9UBS5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GABBR1Q9UBS5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GABBR1Q9UBS5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABBR1Q9UBS5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABBR1Q9UBS5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABBR1Q9UBS5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABBR1Q9UBS5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABBR1Q9UBS5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABBR1Q9UBS5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABBR1Q9UBS5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABBR1Q9UBS5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABBR1Q9UBS5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABBR1Q9UBS5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABBR1Q9UBS5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABBR1Q9UBS5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABBR1Q9UBS5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABBR1Q9UBS5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABBR1Q9UBS5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABBR1Q9UBS5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABBR1Q9UBS5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABBR1Q9UBS5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABBR1Q9UBS5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABBR1Q9UBS5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABBR1Q9UBS5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABBR1Q9UBS5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABBR1Q9UBS5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABBR1Q9UBS5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABBR1Q9UBS5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABBR1Q9UBS5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABBR1Q9UBS5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABBR1Q9UBS5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABBR1Q9UBS5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABBR1Q9UBS5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABBR1Q9UBS5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABBR1Q9UBS5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABBR1Q9UBS5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABBR1Q9UBS5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABBR1Q9UBS5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABBR1Q9UBS5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABBR1Q9UBS5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GABBR1Q9UBS5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GABBR1Q9UBS5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABBR1Q9UBS5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABBR1Q9UBS5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABBR1Q9UBS5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABBR1Q9UBS5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABBR1Q9UBS5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABBR1Q9UBS5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABBR1Q9UBS5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.8 ms