Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M7

CGN, Cingulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNQ9P2M7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGNQ9P2M7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CGNQ9P2M7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CGNQ9P2M7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms