Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRP2BPQ9P2M1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRP2BPQ9P2M1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRP2BPQ9P2M1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRP2BPQ9P2M1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
LRP2BPQ9P2M1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRP2BPQ9P2M1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRP2BPQ9P2M1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRP2BPQ9P2M1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRP2BPQ9P2M1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
LRP2BPQ9P2M1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
LRP2BPQ9P2M1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRP2BPQ9P2M1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRP2BPQ9P2M1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRP2BPQ9P2M1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRP2BPQ9P2M1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRP2BPQ9P2M1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRP2BPQ9P2M1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRP2BPQ9P2M1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRP2BPQ9P2M1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRP2BPQ9P2M1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRP2BPQ9P2M1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRP2BPQ9P2M1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRP2BPQ9P2M1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRP2BPQ9P2M1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRP2BPQ9P2M1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LRP2BPQ9P2M1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRP2BPQ9P2M1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRP2BPQ9P2M1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRP2BPQ9P2M1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRP2BPQ9P2M1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRP2BPQ9P2M1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRP2BPQ9P2M1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRP2BPQ9P2M1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRP2BPQ9P2M1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRP2BPQ9P2M1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRP2BPQ9P2M1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms