Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL42Q9P2K6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms