Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PHRF1Q9P1Y6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PHRF1Q9P1Y6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PHRF1Q9P1Y6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
PHRF1Q9P1Y6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PHRF1Q9P1Y6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PHRF1Q9P1Y6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
PHRF1Q9P1Y6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PHRF1Q9P1Y6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PHRF1Q9P1Y6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PHRF1Q9P1Y6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PHRF1Q9P1Y6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PHRF1Q9P1Y6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PHRF1Q9P1Y6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PHRF1Q9P1Y6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
PHRF1Q9P1Y6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PHRF1Q9P1Y6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PHRF1Q9P1Y6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PHRF1Q9P1Y6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PHRF1Q9P1Y6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PHRF1Q9P1Y6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PHRF1Q9P1Y6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PHRF1Q9P1Y6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PHRF1Q9P1Y6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PHRF1Q9P1Y6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PHRF1Q9P1Y6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PHRF1Q9P1Y6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PHRF1Q9P1Y6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PHRF1Q9P1Y6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PHRF1Q9P1Y6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PHRF1Q9P1Y6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PHRF1Q9P1Y6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PHRF1Q9P1Y6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PHRF1Q9P1Y6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PHRF1Q9P1Y6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PHRF1Q9P1Y6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PHRF1Q9P1Y6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PHRF1Q9P1Y6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PHRF1Q9P1Y6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PHRF1Q9P1Y6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PHRF1Q9P1Y6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
PHRF1Q9P1Y6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC30■■■□□ 2.39
PHRF1Q9P1Y6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC30■■■□□ 2.39
PHRF1Q9P1Y6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
PHRF1Q9P1Y6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PHRF1Q9P1Y6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PHRF1Q9P1Y6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PHRF1Q9P1Y6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PHRF1Q9P1Y6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms