Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ3

NCKIPSD, NCK-interacting protein with SH3 domain, humanhuman

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKIPSDQ9NZQ3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCKIPSDQ9NZQ3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms