Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

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Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRN3Q9NYV6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRN3Q9NYV6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RRN3Q9NYV6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
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