Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY65

TUBA8, Tubulin alpha-8 chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA8Q9NY65 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBA8Q9NY65 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBA8Q9NY65 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBA8Q9NY65 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBA8Q9NY65 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBA8Q9NY65 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBA8Q9NY65 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBA8Q9NY65 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBA8Q9NY65 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBA8Q9NY65 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBA8Q9NY65 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBA8Q9NY65 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBA8Q9NY65 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBA8Q9NY65 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBA8Q9NY65 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBA8Q9NY65 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBA8Q9NY65 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TUBA8Q9NY65 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBA8Q9NY65 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
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