Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CACNA2D2Q9NY47 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D2Q9NY47 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms