Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXX6

NSMCE4A, Non-structural maintenance of chromosomes element 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE4AQ9NXX6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NSMCE4AQ9NXX6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE4AQ9NXX6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms