Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX24

NHP2, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHP2Q9NX24 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHP2Q9NX24 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHP2Q9NX24 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHP2Q9NX24 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHP2Q9NX24 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHP2Q9NX24 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHP2Q9NX24 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHP2Q9NX24 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHP2Q9NX24 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHP2Q9NX24 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHP2Q9NX24 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHP2Q9NX24 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHP2Q9NX24 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHP2Q9NX24 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHP2Q9NX24 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHP2Q9NX24 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHP2Q9NX24 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHP2Q9NX24 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NHP2Q9NX24 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NHP2Q9NX24 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NHP2Q9NX24 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NHP2Q9NX24 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms