Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
COMMD8Q9NX08 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms