Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWK9

ZNHIT6, Box C/D snoRNA protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT6Q9NWK9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNHIT6Q9NWK9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNHIT6Q9NWK9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNHIT6Q9NWK9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNHIT6Q9NWK9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNHIT6Q9NWK9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNHIT6Q9NWK9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNHIT6Q9NWK9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNHIT6Q9NWK9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNHIT6Q9NWK9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNHIT6Q9NWK9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNHIT6Q9NWK9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNHIT6Q9NWK9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNHIT6Q9NWK9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNHIT6Q9NWK9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNHIT6Q9NWK9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNHIT6Q9NWK9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNHIT6Q9NWK9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNHIT6Q9NWK9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNHIT6Q9NWK9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNHIT6Q9NWK9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNHIT6Q9NWK9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNHIT6Q9NWK9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNHIT6Q9NWK9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNHIT6Q9NWK9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNHIT6Q9NWK9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNHIT6Q9NWK9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNHIT6Q9NWK9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNHIT6Q9NWK9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNHIT6Q9NWK9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNHIT6Q9NWK9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNHIT6Q9NWK9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNHIT6Q9NWK9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNHIT6Q9NWK9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms