Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RLIMQ9NVW2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RLIMQ9NVW2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RLIMQ9NVW2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RLIMQ9NVW2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RLIMQ9NVW2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RLIMQ9NVW2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RLIMQ9NVW2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RLIMQ9NVW2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RLIMQ9NVW2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RLIMQ9NVW2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RLIMQ9NVW2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RLIMQ9NVW2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RLIMQ9NVW2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RLIMQ9NVW2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RLIMQ9NVW2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RLIMQ9NVW2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RLIMQ9NVW2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RLIMQ9NVW2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RLIMQ9NVW2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RLIMQ9NVW2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RLIMQ9NVW2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RLIMQ9NVW2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RLIMQ9NVW2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RLIMQ9NVW2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RLIMQ9NVW2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RLIMQ9NVW2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RLIMQ9NVW2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RLIMQ9NVW2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RLIMQ9NVW2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RLIMQ9NVW2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RLIMQ9NVW2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RLIMQ9NVW2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RLIMQ9NVW2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RLIMQ9NVW2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RLIMQ9NVW2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RLIMQ9NVW2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RLIMQ9NVW2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RLIMQ9NVW2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RLIMQ9NVW2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RLIMQ9NVW2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RLIMQ9NVW2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RLIMQ9NVW2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RLIMQ9NVW2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RLIMQ9NVW2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms