Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLHL11Q9NVR0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms