Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV31

IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP3Q9NV31 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
IMP3Q9NV31 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms