Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC33.43■■■□□ 2.94
RRP7BPQ9NSQ0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
RRP7BPQ9NSQ0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
RRP7BPQ9NSQ0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
RRP7BPQ9NSQ0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC33.43■■■□□ 2.94
RRP7BPQ9NSQ0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
RRP7BPQ9NSQ0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
RRP7BPQ9NSQ0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
RRP7BPQ9NSQ0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
RRP7BPQ9NSQ0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
RRP7BPQ9NSQ0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
RRP7BPQ9NSQ0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
RRP7BPQ9NSQ0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
RRP7BPQ9NSQ0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RRP7BPQ9NSQ0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
RRP7BPQ9NSQ0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
RRP7BPQ9NSQ0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
RRP7BPQ9NSQ0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
RRP7BPQ9NSQ0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RRP7BPQ9NSQ0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
RRP7BPQ9NSQ0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
RRP7BPQ9NSQ0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
RRP7BPQ9NSQ0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
RRP7BPQ9NSQ0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
RRP7BPQ9NSQ0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
RRP7BPQ9NSQ0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
RRP7BPQ9NSQ0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
RRP7BPQ9NSQ0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
RRP7BPQ9NSQ0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RRP7BPQ9NSQ0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RRP7BPQ9NSQ0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RRP7BPQ9NSQ0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RRP7BPQ9NSQ0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RRP7BPQ9NSQ0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RRP7BPQ9NSQ0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RRP7BPQ9NSQ0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC33.35■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
RRP7BPQ9NSQ0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
RRP7BPQ9NSQ0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RRP7BPQ9NSQ0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
RRP7BPQ9NSQ0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
RRP7BPQ9NSQ0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
RRP7BPQ9NSQ0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
RRP7BPQ9NSQ0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms