Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF275Q9NSD4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF275Q9NSD4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms