Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOMER3Q9NSC5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOMER3Q9NSC5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms