Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCND1Q9NSA2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KCND1Q9NSA2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KCND1Q9NSA2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KCND1Q9NSA2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KCND1Q9NSA2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KCND1Q9NSA2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KCND1Q9NSA2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KCND1Q9NSA2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCND1Q9NSA2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCND1Q9NSA2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCND1Q9NSA2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCND1Q9NSA2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
KCND1Q9NSA2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCND1Q9NSA2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
KCND1Q9NSA2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCND1Q9NSA2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCND1Q9NSA2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCND1Q9NSA2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCND1Q9NSA2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCND1Q9NSA2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCND1Q9NSA2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCND1Q9NSA2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCND1Q9NSA2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCND1Q9NSA2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
KCND1Q9NSA2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCND1Q9NSA2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCND1Q9NSA2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCND1Q9NSA2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCND1Q9NSA2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCND1Q9NSA2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCND1Q9NSA2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCND1Q9NSA2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCND1Q9NSA2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms