Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB6BQ9NRW1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB6BQ9NRW1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB6BQ9NRW1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB6BQ9NRW1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB6BQ9NRW1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB6BQ9NRW1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms