Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SH2B1Q9NRF2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SH2B1Q9NRF2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH2B1Q9NRF2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms