Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF3Q9NR81 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF3Q9NR81 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms